Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UIMC1Q96RL1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UIMC1Q96RL1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
UIMC1Q96RL1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
UIMC1Q96RL1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
UIMC1Q96RL1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UIMC1Q96RL1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UIMC1Q96RL1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UIMC1Q96RL1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UIMC1Q96RL1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms