Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HHIPQ96QV1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HHIPQ96QV1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HHIPQ96QV1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HHIPQ96QV1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HHIPQ96QV1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HHIPQ96QV1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HHIPQ96QV1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HHIPQ96QV1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HHIPQ96QV1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HHIPQ96QV1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HHIPQ96QV1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HHIPQ96QV1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HHIPQ96QV1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HHIPQ96QV1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HHIPQ96QV1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HHIPQ96QV1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HHIPQ96QV1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HHIPQ96QV1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HHIPQ96QV1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HHIPQ96QV1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HHIPQ96QV1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HHIPQ96QV1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HHIPQ96QV1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HHIPQ96QV1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HHIPQ96QV1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HHIPQ96QV1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HHIPQ96QV1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HHIPQ96QV1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HHIPQ96QV1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HHIPQ96QV1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HHIPQ96QV1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HHIPQ96QV1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HHIPQ96QV1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HHIPQ96QV1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HHIPQ96QV1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HHIPQ96QV1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HHIPQ96QV1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HHIPQ96QV1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms