Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DEPDC7Q96QD5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DEPDC7Q96QD5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DEPDC7Q96QD5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEPDC7Q96QD5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEPDC7Q96QD5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEPDC7Q96QD5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEPDC7Q96QD5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEPDC7Q96QD5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEPDC7Q96QD5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEPDC7Q96QD5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DEPDC7Q96QD5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEPDC7Q96QD5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DEPDC7Q96QD5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.2 ms