Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4LQ96PU5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4LQ96PU5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4LQ96PU5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4LQ96PU5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4LQ96PU5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4LQ96PU5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4LQ96PU5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4LQ96PU5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD4LQ96PU5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD4LQ96PU5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4LQ96PU5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4LQ96PU5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms