Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZIM3Q96PE6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZIM3Q96PE6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZIM3Q96PE6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZIM3Q96PE6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZIM3Q96PE6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZIM3Q96PE6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZIM3Q96PE6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZIM3Q96PE6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZIM3Q96PE6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZIM3Q96PE6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZIM3Q96PE6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZIM3Q96PE6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ZIM3Q96PE6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZIM3Q96PE6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZIM3Q96PE6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZIM3Q96PE6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms