Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMTM3Q96MX0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMTM3Q96MX0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMTM3Q96MX0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMTM3Q96MX0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMTM3Q96MX0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMTM3Q96MX0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM3Q96MX0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM3Q96MX0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM3Q96MX0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM3Q96MX0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM3Q96MX0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM3Q96MX0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM3Q96MX0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM3Q96MX0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM3Q96MX0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CMTM3Q96MX0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms