Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE2Q96MF7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NSMCE2Q96MF7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NSMCE2Q96MF7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms