Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD4Q96M96 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD4Q96M96 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD4Q96M96 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD4Q96M96 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD4Q96M96 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD4Q96M96 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD4Q96M96 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD4Q96M96 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD4Q96M96 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms