Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABS1Q96KC9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABS1Q96KC9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABS1Q96KC9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABS1Q96KC9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms