Protein–RNA interactions for Protein: Q96HR3

MED30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED30Q96HR3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED30Q96HR3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED30Q96HR3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED30Q96HR3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms