Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RNF185Q96GF1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RNF185Q96GF1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF185Q96GF1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF185Q96GF1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF185Q96GF1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF185Q96GF1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF185Q96GF1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF185Q96GF1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF185Q96GF1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF185Q96GF1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF185Q96GF1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF185Q96GF1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF185Q96GF1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF185Q96GF1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RNF185Q96GF1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF185Q96GF1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF185Q96GF1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF185Q96GF1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF185Q96GF1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF185Q96GF1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF185Q96GF1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF185Q96GF1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF185Q96GF1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF185Q96GF1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF185Q96GF1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF185Q96GF1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF185Q96GF1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF185Q96GF1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms