Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIPA1Q96FS4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIPA1Q96FS4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIPA1Q96FS4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIPA1Q96FS4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SIPA1Q96FS4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIPA1Q96FS4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIPA1Q96FS4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIPA1Q96FS4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIPA1Q96FS4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIPA1Q96FS4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIPA1Q96FS4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIPA1Q96FS4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIPA1Q96FS4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIPA1Q96FS4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIPA1Q96FS4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIPA1Q96FS4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161 ms