Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM44Q96DX7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM44Q96DX7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM44Q96DX7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM44Q96DX7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM44Q96DX7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM44Q96DX7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM44Q96DX7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM44Q96DX7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM44Q96DX7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM44Q96DX7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM44Q96DX7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM44Q96DX7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM44Q96DX7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM44Q96DX7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM44Q96DX7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM44Q96DX7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM44Q96DX7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM44Q96DX7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM44Q96DX7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms