Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTP4Q969X6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UTP4Q969X6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UTP4Q969X6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UTP4Q969X6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
UTP4Q969X6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UTP4Q969X6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTP4Q969X6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTP4Q969X6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTP4Q969X6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTP4Q969X6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP4Q969X6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP4Q969X6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP4Q969X6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP4Q969X6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP4Q969X6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UTP4Q969X6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UTP4Q969X6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms