Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
PRG4Q92954 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
PRG4Q92954 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
PRG4Q92954 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
PRG4Q92954 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
PRG4Q92954 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
PRG4Q92954 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
PRG4Q92954 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
PRG4Q92954 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
PRG4Q92954 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
PRG4Q92954 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
PRG4Q92954 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
PRG4Q92954 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
PRG4Q92954 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
PRG4Q92954 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
PRG4Q92954 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
PRG4Q92954 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
PRG4Q92954 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
PRG4Q92954 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
PRG4Q92954 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
PRG4Q92954 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
PRG4Q92954 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
PRG4Q92954 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
PRG4Q92954 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
PRG4Q92954 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
PRG4Q92954 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
PRG4Q92954 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
PRG4Q92954 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
PRG4Q92954 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
PRG4Q92954 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
PRG4Q92954 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
PRG4Q92954 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
PRG4Q92954 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
PRG4Q92954 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
PRG4Q92954 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
PRG4Q92954 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
PRG4Q92954 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
PRG4Q92954 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
PRG4Q92954 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
PRG4Q92954 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
PRG4Q92954 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
PRG4Q92954 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
PRG4Q92954 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
PRG4Q92954 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
PRG4Q92954 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
PRG4Q92954 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
PRG4Q92954 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
PRG4Q92954 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
PRG4Q92954 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
PRG4Q92954 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
PRG4Q92954 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
PRG4Q92954 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
PRG4Q92954 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
PRG4Q92954 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
PRG4Q92954 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
PRG4Q92954 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
PRG4Q92954 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
PRG4Q92954 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
PRG4Q92954 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
PRG4Q92954 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
PRG4Q92954 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
PRG4Q92954 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
PRG4Q92954 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
PRG4Q92954 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
PRG4Q92954 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
PRG4Q92954 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
PRG4Q92954 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC41.69■■■■■ 4.27
PRG4Q92954 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.27
PRG4Q92954 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC41.65■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
PRG4Q92954 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
PRG4Q92954 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
PRG4Q92954 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
PRG4Q92954 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
PRG4Q92954 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
PRG4Q92954 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
PRG4Q92954 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
PRG4Q92954 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
PRG4Q92954 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
PRG4Q92954 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
PRG4Q92954 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
PRG4Q92954 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC41.59■■■■■ 4.25
PRG4Q92954 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms