Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCSTNQ92542 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NCSTNQ92542 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCSTNQ92542 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCSTNQ92542 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NCSTNQ92542 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCSTNQ92542 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCSTNQ92542 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCSTNQ92542 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCSTNQ92542 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCSTNQ92542 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCSTNQ92542 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCSTNQ92542 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCSTNQ92542 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCSTNQ92542 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCSTNQ92542 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCSTNQ92542 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCSTNQ92542 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCSTNQ92542 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCSTNQ92542 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms