Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRTOMTQ8WZ04 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRTOMTQ8WZ04 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRTOMTQ8WZ04 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRTOMTQ8WZ04 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRTOMTQ8WZ04 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRTOMTQ8WZ04 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRTOMTQ8WZ04 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRTOMTQ8WZ04 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRTOMTQ8WZ04 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRTOMTQ8WZ04 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRTOMTQ8WZ04 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRTOMTQ8WZ04 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRTOMTQ8WZ04 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRTOMTQ8WZ04 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRTOMTQ8WZ04 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRTOMTQ8WZ04 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRTOMTQ8WZ04 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRTOMTQ8WZ04 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRTOMTQ8WZ04 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRTOMTQ8WZ04 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRTOMTQ8WZ04 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRTOMTQ8WZ04 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRTOMTQ8WZ04 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRTOMTQ8WZ04 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRTOMTQ8WZ04 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRTOMTQ8WZ04 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRTOMTQ8WZ04 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRTOMTQ8WZ04 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRTOMTQ8WZ04 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRTOMTQ8WZ04 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRTOMTQ8WZ04 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRTOMTQ8WZ04 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRTOMTQ8WZ04 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRTOMTQ8WZ04 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms