Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
TRIM41Q8WV44 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
TRIM41Q8WV44 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
TRIM41Q8WV44 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
TRIM41Q8WV44 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
TRIM41Q8WV44 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
TRIM41Q8WV44 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
TRIM41Q8WV44 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
TRIM41Q8WV44 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
TRIM41Q8WV44 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
TRIM41Q8WV44 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
TRIM41Q8WV44 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
TRIM41Q8WV44 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
TRIM41Q8WV44 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
TRIM41Q8WV44 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
TRIM41Q8WV44 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
TRIM41Q8WV44 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
TRIM41Q8WV44 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
TRIM41Q8WV44 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
TRIM41Q8WV44 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
TRIM41Q8WV44 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
TRIM41Q8WV44 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
TRIM41Q8WV44 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
TRIM41Q8WV44 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
TRIM41Q8WV44 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
TRIM41Q8WV44 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
TRIM41Q8WV44 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
TRIM41Q8WV44 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
TRIM41Q8WV44 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC44.24■■■■■ 4.67
TRIM41Q8WV44 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
TRIM41Q8WV44 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
TRIM41Q8WV44 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
TRIM41Q8WV44 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
TRIM41Q8WV44 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
TRIM41Q8WV44 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
TRIM41Q8WV44 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
TRIM41Q8WV44 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
TRIM41Q8WV44 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
TRIM41Q8WV44 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
TRIM41Q8WV44 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
TRIM41Q8WV44 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC44.18■■■■■ 4.66
TRIM41Q8WV44 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
TRIM41Q8WV44 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
TRIM41Q8WV44 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
TRIM41Q8WV44 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
TRIM41Q8WV44 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
TRIM41Q8WV44 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
TRIM41Q8WV44 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
TRIM41Q8WV44 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
TRIM41Q8WV44 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
TRIM41Q8WV44 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
TRIM41Q8WV44 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
TRIM41Q8WV44 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
TRIM41Q8WV44 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC44.13■■■■■ 4.66
TRIM41Q8WV44 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
TRIM41Q8WV44 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
TRIM41Q8WV44 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
TRIM41Q8WV44 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
TRIM41Q8WV44 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
TRIM41Q8WV44 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
TRIM41Q8WV44 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
TRIM41Q8WV44 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
TRIM41Q8WV44 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
TRIM41Q8WV44 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
TRIM41Q8WV44 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
TRIM41Q8WV44 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
TRIM41Q8WV44 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
TRIM41Q8WV44 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
TRIM41Q8WV44 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
TRIM41Q8WV44 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC43.98■■■■■ 4.63
TRIM41Q8WV44 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
TRIM41Q8WV44 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
TRIM41Q8WV44 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC43.97■■■■■ 4.63
TRIM41Q8WV44 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
TRIM41Q8WV44 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
TRIM41Q8WV44 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
TRIM41Q8WV44 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
TRIM41Q8WV44 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
TRIM41Q8WV44 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
TRIM41Q8WV44 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
TRIM41Q8WV44 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms