Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRN4Q8WUT4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRN4Q8WUT4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRN4Q8WUT4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRN4Q8WUT4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRN4Q8WUT4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRN4Q8WUT4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRN4Q8WUT4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRN4Q8WUT4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRN4Q8WUT4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRN4Q8WUT4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRN4Q8WUT4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRN4Q8WUT4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRN4Q8WUT4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRN4Q8WUT4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRN4Q8WUT4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRN4Q8WUT4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRN4Q8WUT4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRN4Q8WUT4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRN4Q8WUT4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRN4Q8WUT4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRN4Q8WUT4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRN4Q8WUT4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRN4Q8WUT4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRN4Q8WUT4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRN4Q8WUT4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRN4Q8WUT4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRN4Q8WUT4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRN4Q8WUT4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRN4Q8WUT4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRN4Q8WUT4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRN4Q8WUT4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRN4Q8WUT4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms