Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZFP28Q8NHY6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZFP28Q8NHY6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZFP28Q8NHY6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFP28Q8NHY6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms