Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KNL1Q8NG31 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KNL1Q8NG31 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNL1Q8NG31 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KNL1Q8NG31 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNL1Q8NG31 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNL1Q8NG31 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNL1Q8NG31 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNL1Q8NG31 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNL1Q8NG31 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNL1Q8NG31 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNL1Q8NG31 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNL1Q8NG31 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNL1Q8NG31 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KNL1Q8NG31 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNL1Q8NG31 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNL1Q8NG31 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KNL1Q8NG31 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms