Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYRIPQ8NFW9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYRIPQ8NFW9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYRIPQ8NFW9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYRIPQ8NFW9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYRIPQ8NFW9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYRIPQ8NFW9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYRIPQ8NFW9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYRIPQ8NFW9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYRIPQ8NFW9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYRIPQ8NFW9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYRIPQ8NFW9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYRIPQ8NFW9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYRIPQ8NFW9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYRIPQ8NFW9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MYRIPQ8NFW9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYRIPQ8NFW9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MYRIPQ8NFW9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYRIPQ8NFW9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYRIPQ8NFW9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYRIPQ8NFW9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYRIPQ8NFW9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYRIPQ8NFW9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MYRIPQ8NFW9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYRIPQ8NFW9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYRIPQ8NFW9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MYRIPQ8NFW9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MYRIPQ8NFW9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MYRIPQ8NFW9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MYRIPQ8NFW9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MYRIPQ8NFW9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MYRIPQ8NFW9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms