Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP4Q8N3C7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLIP4Q8N3C7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIP4Q8N3C7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP4Q8N3C7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLIP4Q8N3C7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP4Q8N3C7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms