Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMYD4Q8IYR2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMYD4Q8IYR2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMYD4Q8IYR2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMYD4Q8IYR2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMYD4Q8IYR2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMYD4Q8IYR2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMYD4Q8IYR2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMYD4Q8IYR2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMYD4Q8IYR2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMYD4Q8IYR2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SMYD4Q8IYR2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SMYD4Q8IYR2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SMYD4Q8IYR2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMYD4Q8IYR2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMYD4Q8IYR2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMYD4Q8IYR2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMYD4Q8IYR2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMYD4Q8IYR2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMYD4Q8IYR2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMYD4Q8IYR2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMYD4Q8IYR2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMYD4Q8IYR2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SMYD4Q8IYR2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMYD4Q8IYR2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SMYD4Q8IYR2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMYD4Q8IYR2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMYD4Q8IYR2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMYD4Q8IYR2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMYD4Q8IYR2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMYD4Q8IYR2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMYD4Q8IYR2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMYD4Q8IYR2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMYD4Q8IYR2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms