Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXK0

PHC2, Polyhomeotic-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC2Q8IXK0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PHC2Q8IXK0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHC2Q8IXK0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHC2Q8IXK0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms