Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HS2ST1Q7LGA3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HS2ST1Q7LGA3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HS2ST1Q7LGA3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms