Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC149Q6ZUS6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC149Q6ZUS6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC149Q6ZUS6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC149Q6ZUS6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC149Q6ZUS6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC149Q6ZUS6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC149Q6ZUS6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC149Q6ZUS6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC149Q6ZUS6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC149Q6ZUS6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC149Q6ZUS6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC149Q6ZUS6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC149Q6ZUS6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC149Q6ZUS6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC149Q6ZUS6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC149Q6ZUS6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC149Q6ZUS6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC149Q6ZUS6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC149Q6ZUS6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC149Q6ZUS6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC149Q6ZUS6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC149Q6ZUS6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC149Q6ZUS6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC149Q6ZUS6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC149Q6ZUS6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC149Q6ZUS6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC149Q6ZUS6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC149Q6ZUS6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC149Q6ZUS6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC149Q6ZUS6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC149Q6ZUS6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC149Q6ZUS6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC149Q6ZUS6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC149Q6ZUS6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC149Q6ZUS6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC149Q6ZUS6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC149Q6ZUS6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC149Q6ZUS6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC149Q6ZUS6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC149Q6ZUS6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC149Q6ZUS6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC149Q6ZUS6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC149Q6ZUS6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC149Q6ZUS6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC149Q6ZUS6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC149Q6ZUS6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC149Q6ZUS6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC149Q6ZUS6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.8 ms