Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC55Q6ZSA7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC55Q6ZSA7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC55Q6ZSA7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC55Q6ZSA7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC55Q6ZSA7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC55Q6ZSA7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC55Q6ZSA7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC55Q6ZSA7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC55Q6ZSA7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC55Q6ZSA7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC55Q6ZSA7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC55Q6ZSA7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC55Q6ZSA7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC55Q6ZSA7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC55Q6ZSA7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC55Q6ZSA7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC55Q6ZSA7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC55Q6ZSA7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC55Q6ZSA7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC55Q6ZSA7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC55Q6ZSA7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC55Q6ZSA7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC55Q6ZSA7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC55Q6ZSA7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC55Q6ZSA7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC55Q6ZSA7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC55Q6ZSA7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC55Q6ZSA7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC55Q6ZSA7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC55Q6ZSA7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC55Q6ZSA7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC55Q6ZSA7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC55Q6ZSA7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC55Q6ZSA7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC55Q6ZSA7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC55Q6ZSA7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC55Q6ZSA7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC55Q6ZSA7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC55Q6ZSA7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC55Q6ZSA7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC55Q6ZSA7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC55Q6ZSA7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC55Q6ZSA7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRC55Q6ZSA7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC55Q6ZSA7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.1 ms