Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIAT1Q6ZQX7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LIAT1Q6ZQX7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms