Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD4L3Q6VB84 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD4L3Q6VB84 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD4L3Q6VB84 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD4L3Q6VB84 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD4L3Q6VB84 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD4L3Q6VB84 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD4L3Q6VB84 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD4L3Q6VB84 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD4L3Q6VB84 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD4L3Q6VB84 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD4L3Q6VB84 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD4L3Q6VB84 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD4L3Q6VB84 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD4L3Q6VB84 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD4L3Q6VB84 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD4L3Q6VB84 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXD4L3Q6VB84 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms