Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI25

CNIH2, Protein cornichon homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH2Q6PI25 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNIH2Q6PI25 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNIH2Q6PI25 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNIH2Q6PI25 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms