Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC62Q6P9F0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC62Q6P9F0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC62Q6P9F0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC62Q6P9F0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC62Q6P9F0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC62Q6P9F0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC62Q6P9F0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC62Q6P9F0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC62Q6P9F0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC62Q6P9F0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC62Q6P9F0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC62Q6P9F0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC62Q6P9F0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC62Q6P9F0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC62Q6P9F0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC62Q6P9F0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC62Q6P9F0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC62Q6P9F0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC62Q6P9F0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC62Q6P9F0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms