Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC8EQ6NSJ5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC8EQ6NSJ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC8EQ6NSJ5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms