Protein–RNA interactions for Protein: Q6EKJ0

GTF2IRD2B, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms