Protein–RNA interactions for Protein: Q6DT37

CDC42BPG, Serine/threonine-protein kinase MRCK gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPGQ6DT37 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CDC42BPGQ6DT37 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDC42BPGQ6DT37 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDC42BPGQ6DT37 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDC42BPGQ6DT37 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CDC42BPGQ6DT37 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDC42BPGQ6DT37 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CDC42BPGQ6DT37 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDC42BPGQ6DT37 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDC42BPGQ6DT37 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDC42BPGQ6DT37 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDC42BPGQ6DT37 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CDC42BPGQ6DT37 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CDC42BPGQ6DT37 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDC42BPGQ6DT37 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CDC42BPGQ6DT37 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
CDC42BPGQ6DT37 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CDC42BPGQ6DT37 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CDC42BPGQ6DT37 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CDC42BPGQ6DT37 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CDC42BPGQ6DT37 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CDC42BPGQ6DT37 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDC42BPGQ6DT37 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDC42BPGQ6DT37 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CDC42BPGQ6DT37 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CDC42BPGQ6DT37 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CDC42BPGQ6DT37 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CDC42BPGQ6DT37 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CDC42BPGQ6DT37 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CDC42BPGQ6DT37 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CDC42BPGQ6DT37 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CDC42BPGQ6DT37 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CDC42BPGQ6DT37 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CDC42BPGQ6DT37 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CDC42BPGQ6DT37 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CDC42BPGQ6DT37 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CDC42BPGQ6DT37 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CDC42BPGQ6DT37 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CDC42BPGQ6DT37 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CDC42BPGQ6DT37 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CDC42BPGQ6DT37 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CDC42BPGQ6DT37 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CDC42BPGQ6DT37 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CDC42BPGQ6DT37 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CDC42BPGQ6DT37 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CDC42BPGQ6DT37 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CDC42BPGQ6DT37 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CDC42BPGQ6DT37 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CDC42BPGQ6DT37 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CDC42BPGQ6DT37 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CDC42BPGQ6DT37 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CDC42BPGQ6DT37 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CDC42BPGQ6DT37 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
CDC42BPGQ6DT37 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CDC42BPGQ6DT37 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CDC42BPGQ6DT37 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CDC42BPGQ6DT37 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CDC42BPGQ6DT37 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CDC42BPGQ6DT37 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDC42BPGQ6DT37 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDC42BPGQ6DT37 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDC42BPGQ6DT37 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDC42BPGQ6DT37 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDC42BPGQ6DT37 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CDC42BPGQ6DT37 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CDC42BPGQ6DT37 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDC42BPGQ6DT37 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CDC42BPGQ6DT37 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CDC42BPGQ6DT37 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
CDC42BPGQ6DT37 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CDC42BPGQ6DT37 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CDC42BPGQ6DT37 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CDC42BPGQ6DT37 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CDC42BPGQ6DT37 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CDC42BPGQ6DT37 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CDC42BPGQ6DT37 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CDC42BPGQ6DT37 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
CDC42BPGQ6DT37 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
CDC42BPGQ6DT37 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
CDC42BPGQ6DT37 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CDC42BPGQ6DT37 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CDC42BPGQ6DT37 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CDC42BPGQ6DT37 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CDC42BPGQ6DT37 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CDC42BPGQ6DT37 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CDC42BPGQ6DT37 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CDC42BPGQ6DT37 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CDC42BPGQ6DT37 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CDC42BPGQ6DT37 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CDC42BPGQ6DT37 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CDC42BPGQ6DT37 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CDC42BPGQ6DT37 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CDC42BPGQ6DT37 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CDC42BPGQ6DT37 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CDC42BPGQ6DT37 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CDC42BPGQ6DT37 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CDC42BPGQ6DT37 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CDC42BPGQ6DT37 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CDC42BPGQ6DT37 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CDC42BPGQ6DT37 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.4 ms