Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT79Q5XKE5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KRT79Q5XKE5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT79Q5XKE5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT79Q5XKE5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT79Q5XKE5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT79Q5XKE5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT79Q5XKE5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT79Q5XKE5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT79Q5XKE5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT79Q5XKE5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT79Q5XKE5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT79Q5XKE5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT79Q5XKE5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KRT79Q5XKE5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KRT79Q5XKE5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT79Q5XKE5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT79Q5XKE5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT79Q5XKE5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT79Q5XKE5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT79Q5XKE5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT79Q5XKE5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT79Q5XKE5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT79Q5XKE5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT79Q5XKE5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT79Q5XKE5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT79Q5XKE5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT79Q5XKE5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT79Q5XKE5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT79Q5XKE5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT79Q5XKE5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT79Q5XKE5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT79Q5XKE5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT79Q5XKE5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms