Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLX4IPQ5VYV7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLX4IPQ5VYV7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLX4IPQ5VYV7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms