Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSBN1Q5VWQ0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSBN1Q5VWQ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSBN1Q5VWQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSBN1Q5VWQ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSBN1Q5VWQ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSBN1Q5VWQ0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSBN1Q5VWQ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSBN1Q5VWQ0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RSBN1Q5VWQ0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RSBN1Q5VWQ0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RSBN1Q5VWQ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RSBN1Q5VWQ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RSBN1Q5VWQ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RSBN1Q5VWQ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RSBN1Q5VWQ0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RSBN1Q5VWQ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RSBN1Q5VWQ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RSBN1Q5VWQ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RSBN1Q5VWQ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RSBN1Q5VWQ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RSBN1Q5VWQ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSBN1Q5VWQ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSBN1Q5VWQ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSBN1Q5VWQ0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSBN1Q5VWQ0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSBN1Q5VWQ0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSBN1Q5VWQ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSBN1Q5VWQ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RSBN1Q5VWQ0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RSBN1Q5VWQ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RSBN1Q5VWQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RSBN1Q5VWQ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RSBN1Q5VWQ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSBN1Q5VWQ0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSBN1Q5VWQ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSBN1Q5VWQ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSBN1Q5VWQ0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSBN1Q5VWQ0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSBN1Q5VWQ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSBN1Q5VWQ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSBN1Q5VWQ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms