Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVC0

C1orf146, Uncharacterized protein C1orf146, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf146Q5VVC0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf146Q5VVC0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf146Q5VVC0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf146Q5VVC0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf146Q5VVC0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf146Q5VVC0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf146Q5VVC0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf146Q5VVC0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf146Q5VVC0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf146Q5VVC0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf146Q5VVC0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf146Q5VVC0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf146Q5VVC0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf146Q5VVC0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf146Q5VVC0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf146Q5VVC0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf146Q5VVC0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1orf146Q5VVC0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf146Q5VVC0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf146Q5VVC0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf146Q5VVC0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf146Q5VVC0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf146Q5VVC0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf146Q5VVC0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf146Q5VVC0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf146Q5VVC0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf146Q5VVC0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf146Q5VVC0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf146Q5VVC0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf146Q5VVC0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms