Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf135Q5VTT2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf135Q5VTT2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms