Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGAP9Q5VTM2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGAP9Q5VTM2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGAP9Q5VTM2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGAP9Q5VTM2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGAP9Q5VTM2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGAP9Q5VTM2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGAP9Q5VTM2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGAP9Q5VTM2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
AGAP9Q5VTM2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGAP9Q5VTM2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGAP9Q5VTM2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGAP9Q5VTM2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGAP9Q5VTM2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGAP9Q5VTM2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGAP9Q5VTM2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AGAP9Q5VTM2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms