Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00242Q5T6M2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00242Q5T6M2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00242Q5T6M2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms