Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms