Protein–RNA interactions for Protein: Q56P42

PYDC2, Pyrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC2Q56P42 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYDC2Q56P42 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYDC2Q56P42 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYDC2Q56P42 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PYDC2Q56P42 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PYDC2Q56P42 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYDC2Q56P42 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYDC2Q56P42 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms