Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
KRTAP21-1Q3LI58 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms