Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC41.25■■■■■ 4.19
FHOD3Q2V2M9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
FHOD3Q2V2M9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
FHOD3Q2V2M9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
FHOD3Q2V2M9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
FHOD3Q2V2M9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
FHOD3Q2V2M9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
FHOD3Q2V2M9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
FHOD3Q2V2M9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC41.21■■■■■ 4.19
FHOD3Q2V2M9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
FHOD3Q2V2M9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
FHOD3Q2V2M9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
FHOD3Q2V2M9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
FHOD3Q2V2M9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
FHOD3Q2V2M9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC41.19■■■■■ 4.18
FHOD3Q2V2M9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
FHOD3Q2V2M9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
FHOD3Q2V2M9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
FHOD3Q2V2M9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
FHOD3Q2V2M9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
FHOD3Q2V2M9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
FHOD3Q2V2M9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
FHOD3Q2V2M9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
FHOD3Q2V2M9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
FHOD3Q2V2M9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
FHOD3Q2V2M9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
FHOD3Q2V2M9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
FHOD3Q2V2M9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
FHOD3Q2V2M9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
FHOD3Q2V2M9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
FHOD3Q2V2M9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
FHOD3Q2V2M9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
FHOD3Q2V2M9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
FHOD3Q2V2M9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
FHOD3Q2V2M9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
FHOD3Q2V2M9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
FHOD3Q2V2M9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
FHOD3Q2V2M9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
FHOD3Q2V2M9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
FHOD3Q2V2M9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
FHOD3Q2V2M9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
FHOD3Q2V2M9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
FHOD3Q2V2M9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.06■■■■■ 4.16
FHOD3Q2V2M9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
FHOD3Q2V2M9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
FHOD3Q2V2M9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
FHOD3Q2V2M9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
FHOD3Q2V2M9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
FHOD3Q2V2M9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC41.04■■■■■ 4.16
FHOD3Q2V2M9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
FHOD3Q2V2M9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
FHOD3Q2V2M9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
FHOD3Q2V2M9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
FHOD3Q2V2M9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
FHOD3Q2V2M9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC41.01■■■■■ 4.15
FHOD3Q2V2M9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
FHOD3Q2V2M9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
FHOD3Q2V2M9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
FHOD3Q2V2M9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
FHOD3Q2V2M9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
FHOD3Q2V2M9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
FHOD3Q2V2M9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
FHOD3Q2V2M9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
FHOD3Q2V2M9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
FHOD3Q2V2M9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
FHOD3Q2V2M9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
FHOD3Q2V2M9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
FHOD3Q2V2M9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
FHOD3Q2V2M9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
FHOD3Q2V2M9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
FHOD3Q2V2M9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
FHOD3Q2V2M9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
FHOD3Q2V2M9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
FHOD3Q2V2M9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
FHOD3Q2V2M9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
FHOD3Q2V2M9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
FHOD3Q2V2M9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
FHOD3Q2V2M9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
FHOD3Q2V2M9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
FHOD3Q2V2M9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
FHOD3Q2V2M9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
FHOD3Q2V2M9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
FHOD3Q2V2M9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
FHOD3Q2V2M9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
FHOD3Q2V2M9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
FHOD3Q2V2M9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.14
FHOD3Q2V2M9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
FHOD3Q2V2M9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
FHOD3Q2V2M9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
FHOD3Q2V2M9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
FHOD3Q2V2M9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
FHOD3Q2V2M9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
FHOD3Q2V2M9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
FHOD3Q2V2M9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.86■■■■■ 4.13
FHOD3Q2V2M9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
FHOD3Q2V2M9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
FHOD3Q2V2M9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
FHOD3Q2V2M9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
FHOD3Q2V2M9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
FHOD3Q2V2M9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms