Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC27Q2M243 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC27Q2M243 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC27Q2M243 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC27Q2M243 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC27Q2M243 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC27Q2M243 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC27Q2M243 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC27Q2M243 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC27Q2M243 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC27Q2M243 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC27Q2M243 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC27Q2M243 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CCDC27Q2M243 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC27Q2M243 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC27Q2M243 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC27Q2M243 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC27Q2M243 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC27Q2M243 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC27Q2M243 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC27Q2M243 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC27Q2M243 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC27Q2M243 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC27Q2M243 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC27Q2M243 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC27Q2M243 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC27Q2M243 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC27Q2M243 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCDC27Q2M243 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC27Q2M243 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC27Q2M243 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC27Q2M243 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC27Q2M243 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC27Q2M243 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC27Q2M243 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC27Q2M243 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC27Q2M243 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC27Q2M243 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC27Q2M243 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC27Q2M243 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC27Q2M243 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC27Q2M243 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC27Q2M243 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC27Q2M243 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC27Q2M243 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC27Q2M243 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC27Q2M243 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC27Q2M243 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC27Q2M243 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC27Q2M243 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC27Q2M243 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC27Q2M243 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC27Q2M243 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC27Q2M243 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC27Q2M243 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms