Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MICBQ29980 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MICBQ29980 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MICBQ29980 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MICBQ29980 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MICBQ29980 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MICBQ29980 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MICBQ29980 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MICBQ29980 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MICBQ29980 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MICBQ29980 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MICBQ29980 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MICBQ29980 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MICBQ29980 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MICBQ29980 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MICBQ29980 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MICBQ29980 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MICBQ29980 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MICBQ29980 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MICBQ29980 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MICBQ29980 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MICBQ29980 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MICBQ29980 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MICBQ29980 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MICBQ29980 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MICBQ29980 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MICBQ29980 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MICBQ29980 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MICBQ29980 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MICBQ29980 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MICBQ29980 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MICBQ29980 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MICBQ29980 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MICBQ29980 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MICBQ29980 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MICBQ29980 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MICBQ29980 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MICBQ29980 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MICBQ29980 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MICBQ29980 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MICBQ29980 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MICBQ29980 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MICBQ29980 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MICBQ29980 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MICBQ29980 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MICBQ29980 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MICBQ29980 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MICBQ29980 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MICBQ29980 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MICBQ29980 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MICBQ29980 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MICBQ29980 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MICBQ29980 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MICBQ29980 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MICBQ29980 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MICBQ29980 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MICBQ29980 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MICBQ29980 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MICBQ29980 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MICBQ29980 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MICBQ29980 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MICBQ29980 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MICBQ29980 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MICBQ29980 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MICBQ29980 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MICBQ29980 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MICBQ29980 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MICBQ29980 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MICBQ29980 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MICBQ29980 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MICBQ29980 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MICBQ29980 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MICBQ29980 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MICBQ29980 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MICBQ29980 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICBQ29980 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICBQ29980 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICBQ29980 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICBQ29980 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICBQ29980 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICBQ29980 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICBQ29980 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICBQ29980 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICBQ29980 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MICBQ29980 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MICBQ29980 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MICBQ29980 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MICBQ29980 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MICBQ29980 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MICBQ29980 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MICBQ29980 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MICBQ29980 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MICBQ29980 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MICBQ29980 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MICBQ29980 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MICBQ29980 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MICBQ29980 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MICBQ29980 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MICBQ29980 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MICBQ29980 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 299.8 ms