Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKN3Q16667 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN3Q16667 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKN3Q16667 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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