Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCD2Q16342 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCD2Q16342 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCD2Q16342 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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